本发明涉及盐碱土壤修复技术领域，尤其是一种盐碱土壤修复功能菌株及其应用。该盐碱土壤修复功能菌株为地衣芽孢杆菌(Bacillus licheniformis)NCT‑1，保藏于中国微生物菌种保藏管理委员会普通微生物中心，保藏日期为2023年8月30日，生物保藏编号为CGMCC NO：28298。将地衣芽孢杆菌发酵生产，然后将发酵液按3‑5％的质量比加入到液体有机原料中得到土壤修复菌剂，进一步按照比例添加无机元素得到复合微生物肥料。本发明的地衣芽孢杆菌NCT‑1及其制得的土壤修复菌剂、肥料，具有有效的盐碱土壤修复效果，对滩涂盐碱土壤效果尤佳。